學(xué)校前身為創(chuàng )建于1909年7月的晚清郵傳部上海高等實(shí)業(yè)學(xué)堂船政科，開(kāi)創(chuàng )了中國高等航海教育的先河。歷經(jīng)郵傳部高等商船學(xué)堂、吳淞商船學(xué)校、交通部吳淞商船專(zhuān)科學(xué)校、國立重慶商船專(zhuān)科學(xué)校、國立吳淞商船專(zhuān)科學(xué)校、上海航務(wù)學(xué)院等時(shí)期。1959年交通部組建上海海運學(xué)院，2004年經(jīng)教育部批準更名為上海海事大學(xué)。2008年上海海事大學(xué)主體搬遷臨港新城。學(xué)校原為交通運輸部直屬高校，2000年劃歸上海市管理。2008年，上海市人民政府與交通運輸部簽訂協(xié)議，共建上海海事大學(xué)。

　　截至2021年5月，學(xué)校有臨港校區（主校區）、港灣校區、民生路高恒大廈等3個(gè)校區，其中臨港校區占地面積133萬(wàn)余平方米，總建筑面積60萬(wàn)平方米；設有二級辦學(xué)部門(mén)，49個(gè)本科專(zhuān)業(yè)；有1個(gè)國家重點(diǎn)（培育）學(xué)科；設有3個(gè)博士后科研流動(dòng)站，4個(gè)一級學(xué)科博士點(diǎn)，16個(gè)一級學(xué)科碩士學(xué)位授權點(diǎn)，13個(gè)碩士專(zhuān)業(yè)學(xué)位授權類(lèi)別；有本科生16000余人，各類(lèi)在校研究生7200余人，留學(xué)生近600名；有專(zhuān)任教師1300余名。