當土壤中含有害物質(zhì)過(guò)多，超過(guò)土壤的自?xún)裟芰Γ蜁?huì )引起土壤的組成、結構和功能發(fā)生變化，微生物活動(dòng)受到抑制，有害物質(zhì)或其分解產(chǎn)物在土壤中逐漸積累通過(guò)“土壤→植物→人體”，或通過(guò)“土壤→水→人體” 間接被人體吸收，達到危害人體健康的程度。
土壤污染的間接危害性：土壤中污染物一方面通過(guò)食物鏈危害動(dòng)物和人體健康，另一方面還能危害自然環(huán)境。例如一些能溶于水的污染物，可從土壤中淋洗到地下水里而使地下水受到污染；另一些懸浮物及土壤所吸附的污染物，可隨地表徑流遷移，造成地表水污染；而污染的土壤被風(fēng)吹到遠離污染源的地方，擴大了污染面。所以土壤污染又間接污染水和大氣，成為水和大氣的污染源。